Organizační struktura Výzkumného ústavu pivovarského a sladařského je patrná z uvedeného schématu.

Z hlediska předmětu výzkumu, vývoje a poskytovaných služeb (rozborů, zkoušek, poradenství) je rozdělení převažujících aktivit jednotlivých pracovišť následující:

- ječmen-slad a rostlinné produkty: laboratoře Sladařského ústavu v Brně,

- oblast pivo-mladina a nápoje:   laboratoře Pivovarského ústavu v Praze.

 Mikrobiologické oddělení, které svou činností pokrývá obě výše uvedené oblasti,  je v Praze v budově Pivovarského ústavu.

Některé speciální rozbory provádějí analytické laboratoře  v Praze  i v Brně.

Konzultace a poradenství týkající se legislativních záležitostí v oboru pivovarství a sladařství jak  v České republice tak i Evropské unii spolu s pomocí při zavádění systémů řízení jakosti poskytuje oddělení legislativy   na  pracovišti v Praze na Korunní ulici.

V budově Pivovarského ústavu v Praze je knihovna a vydavatelství (redakce časopisu Kvasný průmysl).

Na níže uvedených samostatných stránkách jsou uvedeny základní  informace o jednotlivých odděleních ústavu.