VÚPS, a.s., dlouhodobě spolupracuje s řadou jiných ústavů a organizací, s vysokými i středními školami. Některé spolupracující organizace jsou uvedeny níže.

Český svaz pivovarů a sladoven - VÚPS, a.s.  je aktivním členem Svazu, poskytuje poradenské služby a zajišťuje soutěž České pivo.

Český svaz malých nezávislých pivovarů - VÚPS, a.s, poskytuje ČSMNP a jeho členům poradenské služby.

VŠCHT v Praze, Ústav kvasné chemie a bioinženýrství - široká spolupráce na výzkumných projektech, zejména na projektu MŠMT Výzkumné centrum, společné organizování Pivovarsko-sladařských dnů, pedagogická činnost odborníků VÚPS, členství odborníků z VŠCHT v panelech při soutěžích piv, stáže diplomantů ve VÚPS.

Střední průmyslová škola potravinářských technologií, Praha - pedagogická činnost odborníků VÚPS, členství odborníků z SPŠPT v panelech při soutěžích piv, stáže studentů ve VÚPS.

Mendelova univerzita v Brně - široká spolupráce na výzkumných projektech, zejména na projektu MŠMT Výzkumné centrum, pedagogická činnost odborníků VÚPS, stáže diplomantů ve VÚPS.

Mikrobiologický ústav AV ČR, Praha - spolupráce na výzkumných projektech, zejména na projektu MŠMT Výzkumné centrum.

Ústav analytické chemie AV ČR, Brno - spolupráce na výzkumných projektech, zejména na projektu MŠMT Výzkumné centrum.

Zemědělský výzkumný ústav Kroměříž, s.r.o. - spolupráce v rámci  projektu MŠMT Výzkumné centrum.

Chmelařský institut, s.r.o.,  Žatec  - dlouholetá spolupráce na výzkumných projektech.

Vysoké učení technické v Brně - spolupráce na výzkumných projektech, pedagogická činnost odborníků z VÚPS, stáže diplomantů ve VÚPS.